Fragnes s’est appelé anciennement, FRAXUNUM puis FREGNUM, Bourg mi bourguignon, mi bressan avec l’église au vocable de l’Assomption, de construction ancienne mais diverses fois remaniée, Fragne, Fraxinum, Fragnacum, Frenum, était sous le patronage de l’abbé de Cluny et dépendait du diocèse, du bailliage, de la recette de Chalon et de l’archiprêtré de Rully.